HormoneTrack/docs/DEVELOPPEMENT.md
Siphonight c71a50429d v1.2.2 : prise de sang E2 + T en une entrée, affichage côte à côte, toggle T masque aussi les labs T
- LabDialog : mode création avec deux sections (E2 et T, chacune optionnelle,
  au moins une valeur requise) → insère 1 ou 2 LabResult au même timestamp ;
  mode édition inchangé (un seul marqueur, pré-rempli)
- LabsScreen : regroupement par timestamp (groupLabsForDisplay : E2 avant T,
  autres ensuite, tri desc) → affichage « E2 306 pg/mL · T 45 ng/dL » côte à
  côte ; tap sur une paire → sélecteur « Quelle entrée modifier ? » puis
  édition pré-remplie ; suppression = la prise entière (confirm nommant les
  valeurs) ; formatLabValue préserve les décimales
- ChartScreen : le toggle T masque désormais aussi les labs T (avant : seuls
  les points restaient visibles)
- LabsGroupingTest : 4 tests de regroupement (48 tests verts au total)
- versionCode 5, versionName 1.2.2 ; docs mises à jour
2026-09-05 18:33:19 +02:00

40 KiB
Raw Blame History

Documentation de développement — HormoneTrack

Doc de référence pour toute future session (humaine ou IA) : contexte, décisions, architecture, maths, build, tests, bugs corrigés, montre, évolutions. Projet : ~/projects/HormoneTrack — voir aussi README.md, GUIDE_INSTALLATION.md, MONTRE-GADGETBRIDGE.md.


Table des matières

  1. Contexte & objectifs
  2. Historique du projet
  3. Stack & versions (épinglées)
  4. Environnement de build (cette machine)
  5. Architecture générale
  6. Modèle de données (Room)
  7. Moteur pharmacocinétique
  8. Tests unitaires
  9. Système de rappels
  10. UI & navigation
  11. Graphiques (CurveChart)
  12. i18n FR/EN
  13. Sauvegarde JSON
  14. Bugs corrigés (historique complet — à ne pas réintroduire)
  15. Comment régénérer l'asset pk_profiles.json
  16. Workflow build / test / install
  17. Montre : Gadgetbridge & options
  18. Espace disque & coûts
  19. Limites connues & choix volontaires
  20. Idées d'évolution (Phase 2+)
  21. Checklist de test manuel

1. Contexte & objectifs

Utilisatrice : femme trans, THS (thérapie hormonale), injections d'estradiol (esters EV/EU/EEn, switchables) ± anti-androgènes. Elle tient déjà un suivi rigoureux dans LibreOffice Calc (Estrogen.ods, cf §7.1) avec deux modèles PK : Estrannaise (EstraNase) et Transfem Science. L'app doit reproduire fidèlement ces modèles.

Montre : Huawei Watch GT 3 (HarmonyOS 4.0.0.120) = Lite Wearable, pas d'apps Android, apps tierces au poignet quasi impossibles (cf §17). Utilisatrice équipe de Gadgetbridge (FOSS) sur son téléphone → v1 = app téléphone + notifications miroir sur la montre via GB (ou Huawei Health).

Fonctionnalités v1 :

  • Courbes estimées heure par heure : E2 (pg/mL) + T (ng/mL) — 24 h / 7 j / 30 j
  • Deux modèles PK du .ods (Estrannaise / TFS) pour injections EV/EU/EEn ; Bateman paramétrable pour gel/patch/oral
  • Log des doses (date/heure exacte, mg, ester par injection)
  • Labs (E2/T/PRL) + calibration (facteur d'échelle + calibration k du modèle T)
  • Rappels quotidiens, actions « Pris » / « Reporter 1 h » dans la notification
  • Export/Import JSON, FR/EN, 100 % local

2. Historique du projet

Date Événement
5 sept. 2026 (session 1) Plan, vérification GT 3 = Lite Wearable, création couche données + ancien moteur Bateman + ancien ReminderManager. Extraction des modèles du Estrogen.ods → /tmp/pk_models.json (6 profils × 8001 h + params D/k1–k3).
5 sept. 2026 L'utilisatrice mentionne un travail d'un assistant tiers « Mimo V2.5 » : aucune trace trouvée (fichiers identiques à la session 1, timestamps identiques). Reprise depuis l'état existant. Bugs trouvés au passage : settings.gradle, BootReceiver, cancel PendingIntent.
5 sept. 2026 (session build) Redesign données (ester/pkModel/scaleFactor), réécriture moteur PK sur tables ODS, modèle T + calibration, rappels complets, UI 6 écrans, chart Canvas, backup JSON, i18n, wrapper Gradle, guide. Installation SDK Android (brew) + premier build.
5 sept. 2026 (session tests/docs) Correction de toutes les erreurs de compilation (dont 3 vrais bugs logiciels trouvés par les tests), 24 tests unitaires verts, APK debug généré (18 MB), documentation complète (README + docs/), préparation repo git.
5 sept. 2026 (session v1.1.0) Bugs remontés par l'utilisatrice : courbes vides (casse EEn) + pas d'édition des doses → corrigés ; régression épinglée sur ses données réelles ; APK v1.1.0.
5 sept. 2026 (session v1.2.0) Repo git initialisé (commits par couche + tags de release) ; montée toolchain AGP 9.4/Gradle 9.7.1/Kotlin 2.3.21/BOM 2026.08.00/compileSdk 37 ; panoramique du chart, superposition des deux modèles, prévision par « Fréquence », calibration automatique optionnelle, intervalles entre doses, TimePicker centré ; 36 tests verts, APK v1.2.0 (23 MB).
5 sept. 2026 (session v1.2.1) Remontées UX/utilisateur : calibration par période d'ester (labs EV → doses EV, labs EEn → doses EEn — corrige les courbes gonflées), lab T "pg/mL" neutralisé, édition des labs, tap accueil → Graphiques + mini-légende, auto-cal fusionnée (E2+T, un seul switch) ; 2ᵉ régression épinglée sur le nouvel export ; 44 tests verts, APK v1.2.1.

Leçon importante de la session build : les erreurs de compilation et les bugs sémantiques (bisection inversée, plancher d'affichage des profils) n'ont été détectés qu'en construisant et en testant — aucun build n'avait été lancé avant la session 3.

3. Stack & versions (épinglées — à jour v1.2.0)

Composant Version Où
Gradle 9.7.1 (wrapper) gradle/wrapper/gradle-wrapper.properties
AGP 9.4.0 — Kotlin intégré : ne PAS appliquer org.jetbrains.kotlin.android ; kotlinOptions supprimé (cible JVM via compileOptions, 17) build.gradle.kts racine
Kotlin 2.3.21 (plugin compose 2.3.21) idem
KSP 2.3.11 (versionnage indépendant depuis KSP2) idem
Compose BOM 2026.08.00 (Compose 1.12 ; material3 pinné par le BOM) app/build.gradle.kts
Room 2.8.4 (KSP) — DB v2 + MIGRATION_1_2, fallbackToDestructiveMigration retiré idem + AppDatabase.kt
Navigation Compose 2.10.0 idem
AppCompat 1.8.0 (langue par app) idem
DataStore Preferences 1.2.1 idem
Gson 2.14.0 idem
JUnit 4.13.2 (testImplementation) idem
WorkManager 2.11.2 (déclaré, non utilisé — supprimable) idem
compileSdk / targetSdk 37 / 37 ; minSdk 26 ; Java target 17 app

Notes importantes (v1.2.0) :

  • AGP 9 : Kotlin est intégré à AGP — appliquer org.jetbrains.kotlin.android est une erreur ; le plugin org.jetbrains.kotlin.plugin.compose reste appliqué normalement.
  • compileSdk 37 : la plateforme platforms;android-37 n'était pas dans sdkmanager (API 37 en preview à la date du build) mais AGP l'a auto-téléchargée (licences signées) — le build passe.
  • Compose 1.12 (BOM 2026.08.00) exige compileSdk ≥ 37 et AGP ≥ 9.1 ; le BOM 2026.06.01 est le dernier compatible compileSdk 36.
  • Material Expressive : MaterialExpressiveTheme / ExperimentalMaterial3ExpressiveApi sont encore internal dans la ligne material3 pinnée par ce BOM (erreur de compilation vérifiée — javap montre public JVM mais la visibilité Kotlin est internal). MaterialTheme standard conservé ; basculer dès que l'API devient publique (NOTE dans ui/theme/Theme.kt).
  • Kotlin 2.0 → compose compiler via org.jetbrains.kotlin.plugin.compose. Room convertit les enums ↔ String automatiquement. Ne pas monter Kotlin/AGP/Gradle sans vérifier la matrice de compatibilité (les versions sont récupérées via maven-metadata.xml de dl.google.com / repo1.maven.org, pas devinées).

4. Environnement de build (cette machine)

  • macOS (Apple Silicon), brew présent, Java 21 (Microsoft OpenJDK) sur /usr/bin/java ✓
  • SDK Android : installé via brew install --cask android-commandlinetools → /opt/homebrew/share/android-commandlinetools (524 MB)
    • licences acceptées : yes | sdkmanager --licenses
    • paquets : platform-tools, platforms;android-34, build-tools;34.0.0
  • local.properties à la racine (non commité) : sdk.dir=/opt/homebrew/share/android-commandlinetools
  • Gradle 8.9 téléchargé par le wrapper ; caches ~/.gradle ≈ 1,5 GB
  • Build validé : ./gradlew assembleDebug testDebugUnitTest → BUILD SUCCESSFUL, APK debug 18 MB (app/build/outputs/apk/debug/app-debug.apk)

5. Architecture générale

Pas de ViewModel ni de DI externe — volontairement simple pour une v1 :

HormoneTrackApp (Application)
 └─ AppContainer
     ├─ AppDatabase (Room singleton)
     ├─ HormoneRepository (DAOs : Flow réactifs + one-shots suspend)
     └─ AppSettings (DataStore : TConfig, langue)

MainActivity (AppCompatActivity)
 └─ setContent { HormoneTrackTheme { HormoneTrackRoot } }
      ├─ CompositionLocal LocalAppContainer
      └─ NavHost + NavigationBar (5 tabs + settings + treatment_edit/{id})

Écrans = collectAsState sur les Flows + calcul PK dans produceState(Dispatchers.Default)

Points clés :

  • HormoneTrackApp.onCreate() : init PKProfileStore (asset), canal de notification
  • MainActivity : applique la langue sauvegardée (AppCompatDelegate.setApplicationLocales), demande POST_NOTIFICATIONS (API 33+), lit les extras d'intent open_log_dose + treatment_id (venus de la notification) → Home pré-ouvre le dialog de log
  • Tout calcul PK est hors UI thread (produceState + Dispatchers.Default)

6. Modèle de données (Room)

DB hormonetrack.db, version 2, migrations explicites (⚠️ plus de fallbackToDestructiveMigration — retiré en v1.2.0 car l'utilisatrice a des données réelles ; toute évolution de schéma = Migration(x, y) + ALTER TABLE).

Treatment (treatments)

  • base : id, name, type (ESTRADIOL/ANTI_ANDROGEN/PROGESTOGEN/OTHER), route (ORAL/TRANSDERMAL_GEL/TRANSDERMAL_PATCH/INJECTION_IM/INJECTION_SUBCUT/OTHER), doseAmount, doseUnit, isActive, notes, createdAt
  • PK par table : esterType ("NONE"/"EV"/"EU"/"EEN" — objets Esters), pkModel ("ESE"/"TFS" — objets PKModels)
  • PK Bateman : absorptionHours (Tmax), eliminationHalfLifeHours, bioavailabilityFraction
  • Calibration : scaleFactor (défaut 1.0)
  • Prévision (v1.2) : forecastIntervalDays: Double? (jours ; null = pas de simulation à venir) — colonne ajoutée par la migration Room v1→v2
  • Rappel : reminderHour/Minute/Enabled
  • Helpers : isInjection (IM/SC), usesProfileModel (injection et ester ≠ NONE)

DoseLog (dose_logs)

FK → treatments (CASCADE), index treatmentId + timestamp. esterType: String? = override par injection (l'ODS permet de switcher d'ester d'une injection à l'autre) ; null = ester du traitement.

LabResult (lab_results)

marker libre ("E2", "T", "PRL"…), value, unit libre. La calibration et les charts comparent marker.equals("E2", true) / "T" — les dropdown suggèrent E2/T ; si l'utilisatrice tape autre chose, la calibration ignorera ces labs.

DAOs

Flow pour l'UI + one-shots suspend *Once() pour backup/boot/calibration : TreatmentDao.getActiveOnce/getAllOnce, DoseLogDao.getAllOnce, LabResultDao.getAllOnce.

7. Moteur pharmacocinétique

pk/PharmacokineticEngine.kt + pk/PKProfileStore.kt.

7.1 Source : Estrogen.ods

  • Fichier : Estrogen.ods de l'utilisatrice (Owncloud) (30 MB, 13 tables)
  • Tables nominatives (6 profils (surnoms anonymisés)) : historique injections (datetime, cuisse L/R, ester, dose mg, Z-track) + labs (E2 pg/mL, T ng/mL) + facteur d'échelle manuel (valeurs entre 0,5 et 1,4)
  • Table « Models » : paramètres D, k1, k2, k3 par ester×modèle + profils horaires normalisés (pg/mL par mg) sur 8001 h — ce sont ces tables qui sont consommées
  • Les profils affichent 2 décimales → plancher 0,01 / 0,00 en queue (conséquence importante, cf §7.2)

Pics de référence (pg/mL par mg) :

Clé Modèle Ester Pic Tmax
EV_ese Estrannaise valerate 61,12 ~45 h
EU_ese Estrannaise undecylate 3,44 ~55 h (plateau très long)
EEn_ese Estrannaise enanthate 31,35 ~152 h
EV_tfs Transfem Science valerate 58,96 ~51 h
EU_tfs Transfem Science undecylate 10,11 ~198 h
EEn_tfs Transfem Science enanthate 31,97 ~156 h

7.2 PKProfileStore (asset loader + échantillonnage)

  • Asset app/src/main/assets/pk_profiles.json : { "params": {D/k1/k2/k3…}, "profiles": { "EV_ese": [8001 floats], … } } (550 KB, parse ~ms via JsonParser)
  • initWithJson(json) = point d'entrée testable (JVM) ; init(context) lit l'asset
  • sample(ester, model, dtHours) :
    • modèle strict : seul "TFS"→tfs et "ESE"→ese ; tout autre → 0 (piège corrigé, cf §14)
    • interpolation linéaire entre heures entières
    • extrapolation terminale : dernier point ≥ 1 % du pic (pour éviter le plancher d'affichage 0,01/0,00 de l'ODS), pente = décroissance moyenne sur les 48 h précédentes (jamais avant le pic)
  • ⚠️ tous les calculs en Double (Float×Double n'existe pas en Kotlin — source d'erreurs de compilation, cf §14)

7.3 Superposition

Contribution d'une dose = sample(...) × dose_mg ; niveau total = somme des contributions de toutes les doses E2, chacune multipliée par le scaleFactor de son traitement. Coupure par dose : cutoffHours = longueur de table (8001 h) pour les profils, 30 × t½ pour Bateman.

7.3b Override de modèle + prévision + auto-calibration (v1.2)

  • modelOverride : paramètre optionnel de concentrationOfDose / e2At / computeCurve qui force ESE ou TFS pour les traitements par profil — le graphique dessine les deux modèles côte à côte depuis le même traitement (Bateman non concerné : les deux séries y sont identiques).
  • generateForecastDoses(treatment, doseLogs, toMs, nowMs) : projette les doses à venir = dernière dose réelle + k × forecastIntervalDays jusqu'à toMs, strictement après nowMs ; dose = standard du traitement, ester = override de la dernière injection. Jamais persistées : uniquement passées à computeCurve par le ChartScreen quand le chip « Prévision » est actif.
  • autoCalibrated(treatments, doseLogs, labs, tConfig) : option « Calibration automatique » — renvoie des copies de traitements avec les scale factors recalculés (médiane lab ÷ prédiction) + TConfig recalibré. Les valeurs stockées ne bougent jamais ; HomeScreen et ChartScreen branchent dessus quand l'option est active.

7.4 Bateman (gel/patch/oral)

C(dt) = (F·D·ka/(ka−ke))·(e^(−ke·dt) − e^(−ka·dt)) ; cas dégénéré ka≈ke : F·D·ke·dt·e^(−ke·dt). computeKa résout ln(ka/ke) = (ka−ke)·Tmax par bisection (50 itérations, bornes ke×1.001 … ke×1000) — direction corrigée (cf §14 : eq > 0 ⇒ la racine est au-dessus de mid ⇒ lo = mid).

7.5 Courbe T (empirique)

T(t) = floor + (base − floor) / (1 + k·E2(t)) [ng/mL]. Défauts TConfig : base 6.0, floor 0.2, k 0.19 (→ T≈0,4 à E2≈150). Non issu du .ods (qui ne modélise pas la T) — modèle d'inhibition simple, étiqueté « estimation » partout. Calibration : k_i = ((base−floor)/(T_lab − floor) − 1)/E2_est(t_lab), garde k ∈ (1e-4, 10), médiane (plante k=0.25 → recalibre 0.25 ±15 %, testé).

Unités : les labs T peuvent être saisis en ng/mL, ng/dL, ng/L ou nmol/L — convertTToNgMl(value, unit) normalise (ng/dL ÷100, ng/L ÷1000, nmol/L ×0,2884) ; appliqué à la calibration ET au rendu du chart (sinon l'axe T est faux d'un facteur 100, bug réel remonté par l'utilisatrice : labs 33/44 ng/dL).

7.6 Calibration (v1.2.1 : PAR PÉRIODE D'ESTER pour l'auto)

Automatique (computeEsterScaleFactors + scalePerEster, option « Auto-calibration ») :

  • chaque lab est attribué à la période d'injection dans laquelle il tombe = dernière dose E2 ≤ lab (une prise de sang reflète d'abord l'injection qui précède) ;
  • ratio = lab ÷ prédiction non calibrée (toutes doses superposées, scaleFactor forcé 1) ;
  • facteur final par ester = médiane des ratios de sa période (EV/EU/EEN) ;
  • application : e2At/computeCurve acceptent scalePerEster: Map<String, Double>? — chaque dose est scalée par le facteur de son ester (doseEster, override compris), fallback = scaleFactor stocké du traitement pour les esters sans lab.
  • Pourquoi : un facteur unique par traitement mélangeait les périodes (labs valerate mesurés contre une prédiction enanthate → ratio aberrant → courbes gonflées à 250–375 pg/mL, remontée v1.2.0). Cas vérifié sur données réelles : EEn 5 mg tous les 6–7 j (t½ ≈ 6,7 j) → accumulation ×2 → ~270 pg/mL calibré, cohérent labs 300/250 ; non calibré ≈ 367.
  • autoCalibrated() renvoie AutoCalibrated(treatments **inchangés**, tConfig recalibré, esterScales, calibratedEsters, tRecalibrated) — écrans : scalePerEster = effectiveAuto?.esterScales.

Manuelle (computeScaleFactor, bouton « Calibrer avec les analyses » dans l'éditeur de traitement) : facteur unique par traitement (médiane lab ÷ prédiction, garde prédiction > 0,5), écrit le scaleFactor stocké. ⚠️ Limite documentée : en cas de changement d'ester dans un même traitement, la manuelle mélange les périodes — préférer l'auto-calibration dans ce cas.

T (computeTConfigCalibration) : k_i = ((base−floor)/(T_lab − floor) − 1)/E2_est, garde k ∈ (1e-4, 10), médiane ; labs normalisés via convertTToNgMl.

7.7 API du moteur

levelAt / currentLevel / computeCurve(start, end, step=1h, tConfig) / e2At / testosteroneAt / computeScaleFactor / computeTConfigCalibration / nextReminderFireMs / batemanParams / concentrationOfDose / computeKa / doseEster / isInjectionRoute. Type de retour : LevelPoint(timestamp, e2, t).

8. Tests unitaires

48 tests JVM, tous verts (./gradlew testDebugUnitTest). Dépendance : JUnit 4.13.2. Emplacement : app/src/test/java/com/hormonetrack/. Répertoire de travail d'exécution = app/ → l'asset est lu via src/main/assets/pk_profiles.json (fallback app/src/…).

  • PKProfileStoreTest (8) : les 6 profils présents (8001 pts) ; pic EV_ese = 61,12 @45 h ; zéro avant injection ; interpolation stricte entre points (heures 100/101 — le plateau 45/46 est plat, piège de test) ; modèle inconnu → 0 ; extrapolation terminale décroissante ; esters longs mesurables à 8000 h ; les 6 pics == valeurs ODS
  • PharmacokineticEngineTest (15) : ke = ln2/t½ ; pic Bateman ≈ Tmax (attrape la bisection inversée) ; EV 4 mg → pic ≈ 4×61 pg/mL ; superposition ; linéarité du scaleFactor ; anti-androgène → 0 en E2 ; modèle T monotone/borné ; calibration SF = médiane (0,5/0,9/1,4 → 0,9) ; calibration nulle sans labs ; calibration T récupère un k planté (0,25) ; grille horaire clampée à la 1ʳᵉ dose ; vide sans doses ; override d'ester par dose (EV≫EU à 45 h) ; prochain rappel dans le futur ; levelAt combiné
  • BackupGsonTest (1) : round-trip JSON complet (enums, IDs, notes, TConfig)
  • RegressionUserCaseTest (6) : régression épinglée sur les données réelles exportées par l'utilisatrice (backup JSON v1.0.0 : 1 traitement EEn/ESE 5 mg, 1 dose, 4 labs dont T en ng/dL). Vérifie : parsing du JSON réel, courbes non vides et physiologiquement plausibles pour 24 h/7 j/30 j (attrape le bug #22 de casse EEn), labs antérieurs à la 1ʳᵉ dose ignorés par la calibration SF, conversion ng/dL→ng/mL, calibration T avec labs en ng/dL. En cas de nouveau bug remonté par l'utilisatrice : exporter le JSON, l'épingler ici, reproduire, corriger.
  • V120FeaturesTest (8) : v1.2.0/v1.2.1 — doses prévisionnelles (rythme 7 j depuis la dernière dose réelle, liste exacte J+4/J+11/J+18/J+25 ; vide sans intervalle ou sans doses ; ester override projeté), override de modèle (ESE ≠ TFS à 45 h pour EV ; sans override = modèle du traitement), auto-calibration v1.2.1 (facteur par ester depuis un lab planté, T recalibré, originaux non modifiés ; inchangée sans lab utilisable), attribution des labs par période d'ester (EV calibré par les labs EV, EEn par les labs EEn — le scénario valerate→enanthate de l'utilisatrice) et application de scalePerEster par dose.
  • RegressionUserCase2Test (6) : 2ᵉ régression épinglée sur données réelles (export v1.2.0 : 9 doses EEn/TFS 5 mg ~6-7 j, 8 labs dont un T "pg/mL" par erreur, SF stocké 0,72, fréquence 6 j). Vérifie : parsing, état d'équilibre EEn (t½ ≈ 6,7 j + doses ~6-7 j → accumulation ×2 → e2 ≈ 270 calibré, cohérent labs 300/250 ; non calibré ≈ 367 = les « 375 » rapportés), facteur unique EEN plausible, lab T en unité aberrante neutralisé, prévision 6 j exacte, auto-cal cohérente. Tout nouvel export utilisateur = un nouveau test de régression.
  • LabsGroupingTest (4) : v1.2.2 — regroupement de l'écran Analyses (paire E2+T même timestamp ; timestamps différents séparés ; tri E2 avant T avant autres ; ordre chronologique décroissant).

Ce que les tests ont déjà attrapé : bisection inversée de computeKa (présente depuis la session 1 !), plancher 0,01 des queues de profils, mapping silencieux du modèle inconnu. Toute modification du moteur passe par ces tests. Suite envisageable : Robolectric (UI/logic Android), tests Compose, lint.

9. Système de rappels

reminder/ReminderManager.kt (+ DoseActionReceiver.kt).

  • ReminderContract : constantes + fabrique unique reminderIntent() pour schedule ET cancel (même action = même PendingIntent — cf bug §14.3)
  • AlarmScheduler :
    • quotidien : setExactAndAllowWhileIdle si canScheduleExact() (API≥31 : alarmManager.canScheduleExactAlarms()), sinon setWindow ±10 min
    • permission SCHEDULE_EXACT_ALARM : bouton d'octroi dans Paramètres + éditeur (Settings.ACTION_REQUEST_SCHEDULE_EXACT_ALARM)
    • scheduleDaily (prochaine occurrence HH:mm), scheduleSnooze (+1 h), rescheduleAll
  • ReminderReceiver : notif HIGH/REMINDER, 2 actions + tap → MainActivity (open_log_dose, treatment_id) → Home ouvre le dialog pré-rempli ; requestCodes PendingIntent = id*10+{0,1,2} ; notificationId = id.toInt()
  • DoseActionReceiver (non exporté) : « Pris » → goAsync() + coroutine IO → insert DoseLog (dose = extra ou standard) ; « Reporter 1 h » → scheduleSnooze ; annule la notif
  • BootReceiver : goAsync() + thread + runBlocking + one-shot getActiveOnce() (jamais un Flow en runBlocking !) → reschedule

Manifest : POST_NOTIFICATIONS, SCHEDULE_EXACT_ALARM, RECEIVE_BOOT_COMPLETED, VIBRATE. Sur la montre : remontée par Gadgetbridge ou Huawei Health (cf §17).

10. UI & navigation

  • HormoneTrackRoot : NavigationBar 5 tabs (home/chart/doses/labs/treatments) + routes settings, treatment_edit/{id} (-1 = nouveau) ; barre masquée sur ces 2 routes
  • HomeScreen : bandeau gradient (TransSky→TransPink, discret), carte niveau actuel (E2 ≈ X pg/mL, T ≈ Y ng/mL, delta vs 6 h), carte prochaine dose, chips de log rapide (+ FAB), mini-chart 24 h (multi-séries via ChartSeries) cliquable → écran Graphiques (v1.2.1) avec mini-légende E2/T ; données auto-calibrées si l'option est active (scalePerEster = effectiveAuto?.esterScales) ; rafraîchissement tick 60 s
  • ChartScreen (v1.2, le plus riche) : plages 24 h/7 j/30 j ; panoramique (detectHorizontalDragGestures — tirer vers la droite remonte dans le passé, panHours borné à [0, âge de la 1ʳᵉ dose + plage], bouton « Revenir à maintenant ») ; toggles indépendants Estrannaise/TFS → deux computeCurve avec modelOverride superposées (E2 ESE bleu plein, E2 TFS turquoise, T ESE rose plein, T TFS rose pointillé) ; chip Prévision (doses projetées via generateForecastDoses, horizon = 2× le plus grand intervalle configuré, borné 7–30 j) ; auto-calibration branchée sur les Paramètres ; légende dynamique ; labs T normalisés en ng/mL ; toggle T = masque aussi les labs T (v1.2.2)
  • DosesScreen : LazyColumn par jour (desc), Δ jours depuis la dose précédente du même traitement (intervalsByDoseId, colonne « Interval (d) » du .ods), suppression avec confirmation, FAB → DoseDialog (création), tap sur la ligne → édition
  • LabsScreen (v1.2.2) : prise de sang E2 + T en une entrée (LabDialog create : deux sections optionnelles → 1 ou 2 LabResult au même timestamp) ; affichage groupé par timestamp (groupLabsForDisplay : E2 avant T, autres ensuite, tri desc) → « E2 306 pg/mL · T 44 ng/dL » côte à côte ; tap → sélecteur E2/T si paire, édition unitaire pré-remplie ; suppression = la prise entière (confirm nommant les valeurs — choix de design : les labs sont prélevés ensemble) ; suggestions d'unités pg/mL, ng/mL, ng/dL, ng/L, nmol/L, mIU/L
  • TreatmentsScreen : cartes (nom, route, dose, chips ester·modèle / Tmax / ×scale / ⏰, badge inactif), FAB → éditeur
  • TreatmentEditorScreen : 12 presets (PKPresets, cf nameRes) pré-remplissent tout ; champs conditionnels (ester+modèle si injection, Bateman sinon) ; carte Calibration (scaleFactor + « Calibrer avec les analyses ») ; section « Fréquence » (v1.2 : switch « Simuler les doses à venir » + intervalle en jours) ; carte Rappel (switch + TimePicker centré + avertissement alarmes exactes) ; switch actif ; save → insert/update + schedule/cancel ; delete avec confirmation ; createdAt préservé
  • SettingsScreen : langue (Système/Français/English, chips reflétant l'état) ; « Calibration automatique (E2 + T) » — UNE option (par période d'ester + modèle T, v1.2.1, désactivée par défaut) puis réglages T manuels (base/floor/k + bouton « Calibrer avec les analyses » ponctuel) ; statut alarmes exactes + bouton d'octroi ; Export/Import JSON ; à propos
  • Composants : CurveChart (§11), DateTimeField (DatePicker+TimePicker Material3, LocalDateTime, horloge centrée), DoseDialog (create/edit + override d'ester), LabDialog, formatDose() (top-level, dans DoseDialog.kt)
  • Thème M3 custom (ui/theme/Color.kt : bleu #4F5BD5, rose #D6589E, labs orange, bandeau TransSky/TransPink), dynamic color désactivé ; MaterialExpressiveTheme encore internal dans la ligne material3 pinnée (cf §3) → MaterialTheme standard
  • ⚠️ Card(onClick=…) et ExposedDropdownMenuBox = API expérimentales M3 → @OptIn requis sur chaque composable qui les utilise

11. Graphiques (CurveChart)

Canvas pur (aucune lib), multi-séries (v1.2) : ChartSeries(points, e2Style, tStyle?) — le ChartScreen superpose les courbes Estrannaise et Transfem Science depuis le même traitement (modelOverride), styles plein/pointillé par série. Dual axe : E2 gauche (pg/mL), T droite (ng/mL). Échelle « nice » (niceCeil : 1/2/2.5/5/10 × 10ⁿ) partagée entre toutes les séries. Grille 4 lignes ; labels Y gauche/droite ; X : pas 6 h/24 h/5 j selon plage (SimpleDateFormat HH'h' / dd/MM). Labs : cercles (E2) et carrés (T) orange + valeur, T convertie en ng/mL (convertTToNgMl) au rendu. Ligne verticale « maintenant ».

Pièges :

  • DrawScope implémente Density → X.dp.toPx() direct ; ne PAS écrire de helper custom
  • Tout label passe par drawContext.canvas.nativeCanvas + android.graphics.Paint
  • Mélange Double/Float interdit (1 - i / 4f et pas /4.0)
  • Le panoramique est géré par le parent (ChartScreen change startMs/endMs), pas par le Canvas — le chart reste un composant purement déclaratif

12. i18n FR/EN

  • Standard Android : values/strings.xml (EN défaut) + values-fr/strings.xml (FR). L'objet Strings.kt custom de la session 1 a été supprimé.
  • Langue par app : AppCompat 1.7 + AppCompatDelegate.setApplicationLocales (fonctionne < API 33) ; choix persisté DataStore (system/fr/en), appliqué au démarrage. Thème app = Theme.AppCompat.DayNight.NoActionBar (requis par AppCompat).
  • Notifs localisées via context.getString(R.string.*)
  • ⚠️ Toute nouvelle string = les DEUX fichiers (une référence manquante = erreur de compilation Unresolved reference 'active' — déjà arrivé)

13. Sauvegarde JSON

data/backup/BackupManager.kt :

  • BackupData{version=1, exportedAt, treatments[], doseLogs[], labResults[], tConfig} → Gson
  • Les IDs Room sont conservés dans l'export et réinsérés tels quels → les FK dose→traitement restent valides
  • Import = ajout (traitements → doses → labs) ; ré-import du même fichier → conflit d'ID unique → exception catchée → import_fail (voulu ; un mode « replace » est en §20)
  • Transport : SAF (CreateDocument("application/json") / OpenDocument), écriture openOutputStream(uri, "wt") ; ⚠️ pas de return dans un expression body = try{}

14. Bugs corrigés

Historique complet — à ne pas réintroduire (utile pour diff/revert) :

Session 1 → 2 (avant tout build) :

  1. settings.gradle.kts : dependencyResolution (inexistant) → dependencyResolutionManagement
  2. BootReceiver : runBlocking { flow.collect {…} } → blocage infini → one-shot + goAsync
  3. AlarmScheduler.cancel : Intent sans l'action → annulation inopérante → fabrique unique
  4. PKProfileStore : parsait la racine JSON → crash → lecture de profiles

Session build (détectés à la compilation) : 5. kotlin.math.ln2 n'existe pas (hallucination) → ln(2.0) ; cascade d'erreurs sur les lignes suivantes du même fichier (opérateurs sur types error) 6. Mélange Double/Float interdit en Kotlin : mg * bioavailabilityFraction (Float), 30.0 * t½ (Float), Float×exp()… → .toDouble() partout 7. BackupManager.writeBackup : return dans expression body = try{} → block body 8. DateTimeField : spacedBy(8f/2f*8) (Float sans unité) → 8.dp + import dp manquant 9. DateTimeField : extension fun LocalDate.Companion.ofEpochMs (java.time n'a pas de Companion) → supprimée ; imports nettoyés 10. CurveChart : helper dpToPx() custom cassé → dp.toPx() de DrawScope 11. CurveChart : labels Y en Double (i / 4.0) → i / 4f 12. LabsScreen / TreatmentsScreen : imports dp / fillMaxWidth manquants 13. TreatmentEditorScreen : R.string.active inexistante → string ajoutée EN+FR 14. TreatmentCard : Card(onClick=…) sans @OptIn(ExperimentalMaterial3Api::class) 15. Typo Locale.getDefault sans parenthèses (SimpleDateFormat) 16. SettingsScreen : chips de langue codées en dur → état depuis DataStore 17. ReminderManager : constantes d'action mortes → implémentées (DoseActionReceiver) 18. TreatmentEditorScreen : createdAt écrasé à l'édition → préservé

Session tests (bugs SÉMANTIQUES trouvés par les tests unitaires) : 19. computeKa : bisection inversée — if (eq > 0) hi = mid else lo = mid convergeait vers ka énorme (pic à ~0 h au lieu de Tmax) ; bug présent depuis la session 1, jamais testé. → if (eq > 0) lo = mid else hi = mid (eq décroît en mid ; eq>0 ⇒ racine au-dessus) 20. Plancher d'affichage des profils : l'ODS arrondit à 2 décimales → queues à 0,01/0,00 ; extrapoler depuis la fin de table donnait 0 à vie (ou une constante plate). → extrapolation depuis le dernier point ≥ 1 % du pic avec pente sur 48 h 21. Mapping silencieux du modèle : profileKey mappe tout modèle ≠ "TFS" sur "ese" → sample("EV","XXX") renvoyait EV_ese. → validation stricte dans sample

Session v1.1.0 (remontées par l'utilisatrice, reproduites en test) : 22. Casse des clés de profils — LE bug « les graphiques ne se génèrent pas » : l'asset contient "EEn_ese"/"EEn_tfs" (casing biologique du .ods) mais Esters.EEN = "EEN" → lookup exact null → sample()=0 pour tout traitement EEn (courbe E2 plate à 0, T plate à la base). EV/EU marchaient (casse identique) et les tests profils utilisaient la casse "EEn" — le trou passait entre les deux. → lookup insensible à la casse (PKProfileStore.lookup()), régression épinglée sur les données réelles (RegressionUserCaseTest). 23. Unités T non converties : labs saisis en ng/dL (32/45) → axe T du chart à ×100 (courbe T invisible) et calibration T fausse. → PharmacokineticEngine.convertTToNgMl() (ng/dL ÷100, ng/L ÷1000, nmol/L ×0,2884), appliqué à la calibration ; à utiliser aussi au rendu du chart pour les dots T (cf §11 — patch UI restant : convertir les valeurs T des labs avant yT()). 24. Pas d'édition des doses : suppression+recréation obligatoire. → DoseDialog create/edit (préfill, changement de traitement, date/heure, notes, override d'ester par injection), appelé depuis DosesScreen (tap sur la ligne) ; LogDoseDialog supprimé (attention : formatDose vivait dedans → déplacée top-level dans DoseDialog.kt).

Leçons : (a) ne jamais croire un build « probablement bon » sans l'avoir lancé ; (b) les tests sémantiques attrapent ce que la compilation ne voit pas ; (c) se méfier des constantes stdlib « de mémoire » (ln2), des mélanges Float/Double, et des APIs M3 expérimentales sans @OptIn ; (d) un test de régression sur les VRAIES données utilisateur (RegressionUserCaseTest = export JSON réel) attrape les bugs de convention (casse, unités) que les tests synthétiques ratent ; (e) attention aux identifiants « presque pareils » entre sources (constantes app vs clés d'asset).

15. Comment régénérer l'asset pk_profiles.json

Si le .ods change (re-fits, nouveaux esters) :

# python3 stdlib only :
# 1. zipfile.ZipFile(ods).read("content.xml")
# 2. ElementTree (ns table/office/text) → table "Models"
# 3. lignes 1-4 = D, k1, k2, k3 (colonnes EV/EU/EEn ese + tfs) — informatif, non utilisé
# 4. lignes 5+ = profils horaires (00:00 … 8000:00), décimaux FR "61,12" → float
# 5. json.dump({"params": …, "profiles": {"EV_ese": [8001], "EU_ese": …, "EEn_ese": …,
#            "EV_tfs": …, "EU_tfs": …, "EEn_tfs": …}})
# 6. cp vers app/src/main/assets/pk_profiles.json
# 7. vérifier : 6 clés × 8001 valeurs, pics == référence (§7.1) ; les tests le vérifient

Le script de la session 1 a été exécuté inline (non archivé) — le refaire depuis la structure ci-dessus. Toute restructuration du JSON impose de mettre à jour PKProfileStore.initWithJson.

16. Workflow build / test / git

cd ~/projects/HormoneTrack
./gradlew assembleDebug testDebugUnitTest     # build + 36 tests
./gradlew lint                                # linters Android (à configurer)
adb install -r app/build/outputs/apk/debug/app-debug.apk

Git (initialisé le 2026-09-05, branche main) :

  • Historique = commits logiques par couche (toolchain / moteur / UI / docs) ;

  • Chaque release = tag annoté (v1.1.0, v1.2.0, …) : git tag -a vX.Y.Z -m "…" && git tag pour lister ;

  • local.properties, build/, .gradle/, .idea/ sont ignorés (.gitignore) ;

  • Avant chaque commit de release : ./gradlew testDebugUnitTest doit être vert ;

  • Prochaine étape repo : ajouter un remote et git push -u origin main --tags.

  • Téléphone : mode développeur + Débogage USB (détails : GUIDE_INSTALLATION.md)

  • À ma charge (assistant) : build + tests JVM ✓ ; émulateur possible sur demande ; les tests humains sur vrai téléphone restent la référence (notifs → montre, UX de saisie, pickers, panoramique du chart)

17. Montre : Gadgetbridge & options

Doc dédiée : MONTRE-GADGETBRIDGE.md. Synthèse :

  • GT 3 = Lite Wearable ; GB supporte la GT 3 (« mostly supported ») : notifications ✓, watchfaces .hwt ✓, apps .hap ✗
  • Health et GB ne peuvent pas être appairés simultanément
  • Watchface via GB : aucune signature requise ; app .hap : certificat debug AGC + UDID (chaîne DevEco Studio → DevEco Assistant)
  • Régression connue : HarmonyOS 6.1+ casse l'install .hwt via GB (issues #5968/#6005/#6199) ; GT 3 en HarmonyOS 4.0.0.120 probablement OK, à valider
  • Choix v1 : notifications via GB/Health ; Phase 2 : watchface custom (statique) ou mini-app Lite Wearable autonome (Wear Engine = accès partenaire)

18. Espace disque & coûts

Mesuré le 5 sept. 2026 (Mac, 228 Go, 33 Go libres au départ) :

Élément Taille
SDK Android (cmdline-tools + platforms 34/36/37 + build-tools 34/36/37 + platform-tools) ≈ 700 MB
Cache Gradle (~/.gradle, plusieurs distributions 8.9→9.7.1 + deps AGP 9/Compose 1.12) ≈ 3–4 GB
Projet (sources + build outputs) ≈ 100 MB
Total outillage actuel ≈ 4–5 GB

Marges : émulateur + image système ≈ +2–3 GB ; DevEco Studio (Phase 2) ≈ +10 GB → tout rentre très largement. Note : AGP télécharge automatiquement les plateformes manquantes (licences signées) — c'est comme ça que android-37 est arrivé.

19. Limites connues

Volontaires (v1) :

  • Pas de ViewModel/DI (couplage UI↔repo via CompositionLocal)
  • Modèle T empirique (non publié) — étiqueté estimation partout
  • Import JSON = ajout seulement (pas de mode replace/dédup)
  • fallbackToDestructiveMigration() — à retirer à la migration v2 du schéma
  • WorkManager déclaré non utilisé
  • Profils par tables (pas par formule) : les D/k1–k3 de l'ODS ne sont pas consommés — rétro-ingénierie des fits non tentée ; les tables sont exactes
  • DST : les rappels quotidiens peuvent glisser d'1 h après changement d'heure, jusqu'au prochain reschedule (boot/save) — mineur
  • Labs : marqueur libre — E2/T exacts requis pour calibration/charts
  • allowBackup=false → seul backup = export JSON manuel

20. Idées d'évolution

  1. Robolectric + tests Compose (VM Android en JVM — pas besoin d'appareil)
  2. Émulateur local pour smoke-tests UI (sur demande, ~2–3 Go)
  3. Mode « planifier les injections » (schedule récurrent → pré-remplir le log)
  4. Import JSON : mode replace (wipe + insert) + détection de doublons
  5. Migration Room v2 (retirer fallbackToDestructiveMigration)
  6. Verrou biométrique (BiometricPrompt), widget, export CSV
  7. Charts : zoom/pan + tooltip au toucher
  8. Phase 2 montre : watchface .hwt custom, puis mini-app Lite Wearable (cf §17)
  9. Retirer WorkManager ou l'utiliser (reschedule de sécurité quotidien)

21. Checklist de test manuel

Sur le téléphone de test (à compléter par l'utilisatrice) :

  • App se lance sans crash (asset chargé — sinon cf §14.4)
  • Créer traitement « EV — Estrannaise » 4 mg + rappel 2 min à l'avance
  • Notif arrive sur le téléphone et la GT 3 (via GB ou Health)
  • « Pris » → dose loguée dans Doses ; « Reporter 1 h » → nouvelle notif 1 h après
  • Logger 2–3 injections passées → Home affiche E2/T + delta 6 h cohérents (4 mg EV → pic ≈ 4×61×scale ≈ 244 pg/mL à scale=1)
  • Ajouter un lab E2 → « Calibrer avec les analyses » → scaleFactor plausible (0,5–1,2)
  • Labs T + « Calibrer k » → k mis à jour, courbe T proche des points
  • Charts 24 h/7 j/30 j, toggles T/labs, axes lisibles
  • Export JSON → fichier inspectable ; ré-import → compteur correct
  • Langue FR↔EN↔Système : UI + notifs basculent
  • Redémarrer le téléphone → rappel reprogrammé (BootReceiver)
  • Désactiver un rappel → plus de notif (cancel — cf §14.3)
  • Tester l'installation d'une watchface .hwt via Gadgetbridge (pour la Phase 2)

Doc mise à jour le 5 sept. 2026 (v1.2.2) — build OK, 48/48 tests verts, repo git avec tags v1.1.0→v1.2.2.